V návaznosti na mimořádný objev byl vypracován projekt rekonstrukce a zpřístupnění rotundy, který umožnil záchranu mimořádně cenné památky a přípravu její prezentace veřejnosti. Akci sice významně podpořily příspěvky z fondů EHP a tzv. Norských fondů, ale celkové náklady byly vyšší; chybějící finanční částku proto fakulta získala veřejnou sbírkou. Rekonstrukci rotundy provázela od začátku výrazná mediální pozornost. Projekt byl nejprve představen zástupcům odborné i laické veřejnosti a poté proběhla řada exkurzí, při nichž si mohli rotundu a průběh prací prohlédnout studenti a vědečtí pracovníci vysokých škol i dalších odborných pracovišť.
Záchrana památky zahrnovala nejen restaurátorské a stavební práce, ale vyžádala si také mimořádně širokou spolupráci s odborníky z dalších profesí. Proběhla obnova zdí a dochovaných částí románské dlažby, která byla doplněna replikami původních dlaždic, i věrohodná výmalba prostor. Výsledná expozice návštěvníky seznamuje nejen s unikátním torzem rotundy, ale i s metodami a postupem prováděných prací. Výsledky archeologického výzkumu a exaktní fyzikální analýzy umožnily vystavit uměle vytvořený řez historickými terény mezi svatováclavským obdobím a dobou vzniku rotundy na konci 11. století. Vznikla počítačová simulace výstavby objektu, použité stavební technologie a podoby rotundy, součástí expozice jsou dále holografická projekce či interaktivní prezentace. Zájemci také mohou rotundu sv. Václava blíže poznat prostřednictvím virtuální 3D prohlídky, dostupné na webové stránce www.rotunda.pano3d.cz.
Na správě rotundy, v níž je nezbytné udržovat přísný klimatický režim, se nadále bude podílet široký tým odborníků. Aby nedocházelo k poškozování památky, podléhá rotunda zvláštnímu režimu provozu, který umožní zpřístupnění široké veřejnosti během významných dnů a při zvláštních příležitostech.
Za hl. město Praha nominovalo územní odborné pracoviště NPÚ v Praze
Na cenu NPÚ v kategorii prezentace hodnot byla navržena Matematicko-fyzikální fakulta Univerzity Karlovy, zastoupená prof. RNDr. Janem Kratochvílem, CSc.